新农合异地就医医保报销流程为：
1.携带好参保人（患者）的有效身份证件、两张一寸彩色照片和新农合医疗证前往县农村合作医疗管理办公室办理好转诊备案手续；
2.出院后，携带参保人（患者）的有效身份证，新农合医疗证，病历复印件，住院小结，住院医疗费用清单，转诊备案手续等前往合作医疗管理办公室进行报销；
需要注意的是，在住院的时候，患者一定要向医生说明办理了农保，这样的话才能办理相关手续，出院的时候也要记得向医院要病历本，医药费用清单等资料凭证并妥善保管，用以进行报销。